miRNA in Milchvesikeln: Esel, Mensch und Rind

Esel-, Frauen- und Kuhmilch stammen aus drei unabhängigen Studien mit unterschiedlicher Probennahme, Vesikelisolierung, Bibliotheksherstellung und Sequenzierung. Die Autoren betonen selbst, dass Unterschiede daher nicht allein der Tierart zugeschrieben werden können; auch Laktationsstadien unterschieden sich (Esel 28–45 Tage, Frauenmilch etwa Tag 50).

Die Eselsdaten beruhen auf drei Stuten eines Betriebs. Ob die Proben D1 und D3 vergleichbar mit Vesikeln angereichert waren, ist offen, da Mikroskopie, Partikelmessung und Markerproteine nur für D2 vorliegen; Reinheit und Ausbeute wurden nicht bestimmt.

Wegen eines festen Pipettiervolumens ging in D1 etwa doppelt so viel RNA in die Bibliothek ein wie in D2 und D3 (2,67 vs. 1,35 ng). Eine Prüfung der RNA-Integrität fand nicht statt, und Unterlagen zu Bibliothekskonzentrationen lagen den Autoren nicht mehr vor.

Nach Neuauswertung werden 261 eindeutige reife Sequenzen beim Esel genannt, obwohl zuvor nur 244 bekannte miRNAs identifiziert wurden. Der Methodenteil nennt nur eine gemeinsame Charge für Bibliotheken und Sequenzierung; dass die Vesikel in zwei Durchgängen isoliert wurden, erwähnt erst der Limitationsteil.

Zielgene und Stoffwechselwege beruhen auf Computervorhersagen, nicht auf Experimenten. Ob miRNAs aus Milchvesikeln Verarbeitung und Verdauung überstehen oder im Körper etwas bewirken, wurde nicht untersucht; die Autoren schließen daraus ausdrücklich keine Wirkung.

Alle Rohdaten wurden mit einem einheitlichen Ablauf neu ausgewertet und nur vollständig identische Sequenzen verglichen. Die Autoren verzichten bewusst auf Signifikanztests zwischen den Datensätzen, legen Einschränkungen ausführlich offen und haben ihre Sequenzdaten öffentlich hinterlegt.